早期的風淋室凈化系統中，風淋電機的起停多為手動控制，潔凈區與自然區通道門也不能自動互鎖，容易由于員工疏忽或貪圖方便不遵守風淋凈化規程造成生產區環境污染。
風淋室是隨著微處理器、傳感器等制造及應用技術的發展，目前的風淋凈化控制系統，不僅有完善可靠的潔凈區與自然區通道門的雙門電磁自動互鎖裝置，通道門是否可靠閉合的光檢測技術及通道門閉合異常情況下的聲光，紅外傳感的風淋電機自動起停及風淋過程精確定時控制，還引入了紫外光細菌殺滅，人性化的語音提示，系統節能降耗等新的設計理念。
風淋室由于近鄰復雜的工業生產環境，加上風淋室凈化控制系統自有的門鎖控制器件電磁動作、電機起停等因素的干擾，在由普通的微處理器構成的風淋凈化控制系統運行可靠性不易得到有效保障的情況下，一些風淋室凈化控制系統的設計采用了工業PLC控制技*，這類系統在滿足主要設計功能的同時，也一定程度上限制了系統對顯示、語音等技*的靈活應用。
