硅酸根分析儀屬于高精密化學分析儀器，為了實現自動在線監測，采用現代微機控制手段，使之能夠具有與手工分析方法一樣的分析結果。
硅酸根分析儀的常見故障及解決方法：
1)零點校準不能完成。經檢查為一通道無水樣,因零點校準總是默認為一通道，所以一通道必須有水樣，將被測樣水中有水樣的接在一通道，故障排除。
2)測量值為零。檢查標樣是否過期或配錯，重新配置標樣;試劑是否配錯或失效，重新配置試劑;泵管老化疲軟，更換泵管;零點閥損壞，在做零點校準時將零點閥出水管(排污管)拔出觀察，檢查R1是否正常。正常測量或斜率標定時常閉端的管子排污口不能有滴液，只有零點校準時校零閥才打開，R1試劑從排污管排走。此次檢查發現零點校準過程無液體漏出，判斷為零點閥損壞，造成校驗零點的時候R1進入光度計進行測量，零點校準異常，從而影響正常測量。更換零點閥，故障排除。
3)在實際應用過程中，出現過零點標定正常，斜率一直標定不了的疑難故障。測量10Oppb硅標液顯示23ppb，測量50ppb硅標液顯示11ppb，較后檢查結果為R3(草酸)配置不當或失效所致，草酸是屏蔽劑，不顯色，但實踐證明，配置不當也會干擾測量。更換草酸，重新配R3試劑，斜率標定正常，測量硅標液也正常。
4)測量值出現高值。SWAN在線硅酸根分析儀采用的是光度法，出現峰值的較大可能是由于氣泡對光度計測量的影響，檢查各個水樣管及試劑管中是否有氣泡并排查漏點;樣品系統漏氣，擰緊試劑管和泵管連接處，檢查消除漏氣部件。
5)在實際工作中，我們還發現硫酸配置不合適，也會造成測量值比實際值偏大許多。如硫酸放置時間太久，酸度降低，所配置的試劑 pH值偏低，達不到標準，正常所配制的硫酸溶液pH值要求在1.1~1.3之間才能合格。
6)在線硅酸根分析儀測量數據大，光度計污染。用5%氨水清洗光度計，故障排除。
7)標定的斜率值偏低，測量精度下降。自動調溫器不加熱影響被測水樣的發色度，被測水樣的發色受溫度的影響，發色度的高低會直接影響顏色梯度，從而影響標定的斜率值(變低)和測量時的分辨率及精度。實驗表明，當硅鉬藍比色法的發色溫度≥25℃時，硅鉬藍顏色的發色度較高(換言之:當發色溫度<25℃時，硅鉬藍的發色受溫度影響，與溫度成正比關系)，更換加熱器，故障排除。
8)測量值不準，加藥系統動力不足。可對測量池排污口的虹吸時間進行檢查，正常一次虹吸的時間間隔2.5min ±5s，若超過該時間，則可判斷加藥系統動力不足，加藥量不夠，也會造成被測水樣的化學反應不，使測量值偏小。此時應檢查加藥系統，如泵、泵軸、泵管、泵傳送帶及泵齒輪組是否正常，對不正常部分進行檢修。
