反相色譜在高效液相色譜儀中是應用廣泛的技術主要是因為它適用于分析極大多數的非極性物質和離子化合物大多數用于反相色譜的固定相都是天然的疏水物質，因此分析物是按照它們與固定相的疏水相互作用的大小來分離的。
反相柱分析物和固定相的基質污染可在使用期間受到影響，應注意的是，固定相逆變器的特殊性質可與由柱壓污染問題分析物相互作用的是結果在分離檢測過程因子反相柱污染有哪些呢？
（1）在高效液相色譜儀反相色譜柱上有自己很多不同填料主要包括一些聚合物聚合物材料表面涂上硅膠和氧化鋁，無機－有機混合物涂層氧化鋯和石墨化碳都存在于我們這些鍵合硅膠上,為增加一個反相色譜柱的應用常利用企業各種社會流動相和添加物作用于反相色譜柱添加物,可以通過改變或修飾填料的表面工作有時候甚至可能會造成污染鍵合相表面硅膠表面的疏水鍵合相是硅烷醇殘留的硅烷醇存在于所有的硅膠鍵合填料中對于這些硅烷醇具有弱酸性，因此他們能與某些待分析物反應能力成為基質細胞成分。
（2）樣品中含有的鹽、脂質、含脂物質、腐質酸、疏水蛋白質和其它一些物質是一些可能在使用時與HPLC柱發生相互作用的物質部分非常疏水的樣品基質，如玉米油，高芳香物質和蠟能粘住固定相裝填表面并且改變其性質,含有蛋白質物質的生物流體也能吸附在填料表面。有些物質有比待測物或少或大的保留值，那些保留值較小的物質如鹽類一般來說在空體積時就被沖出色譜柱，這些非目標產物的被檢測器檢測到而且能形成色譜峰,氣泡,基線上移或者是負峰如果樣品成分在柱子中有很強的保留而且流動相溶液成分不足以把這些物質洗脫下來多次上樣后，這些吸附在柱子表面的物質通常就會積累在柱頭這些行為通常只有通過平行實驗才能發現有著中等保留值的樣品能被緩慢洗出而且表現為寬峰，基線擾動，或者基線漂移。
